市疾控中心完成纳米孔三代测序系统安装及技术培训工作
随着生物科技的不断发展,基因测序技术逐渐成为生物学研究的重要技术手段之一。与前两代测序相比,三代测序最大的特点就是单分子测序,测序过程无需进行PCR扩增,实现了对每一条DNA分子的单独测序,近年来受到广泛关注。为了满足日常检测工作中对三代测序技术应用的需求,提升检验人员对病原微生物分子的检测分析能力,徐州市疾控中心微生物检验科于11月8-9日完成三代测序仪Nanopore GridION的安装工作及三代测序理论和实操培训。
此三代测序系统为英国牛津纳米孔公司所开发,具有超长读长、实时测序、灵活快速、扩展性高、测序耗时短等特点,已应用于基因组测序、甲基化研究和突变鉴定等多个研究领域。微生物检验科工作人员在工程师指导下,经过核酸提取、全基因组捕获及文库构建、基因测序仪运算分析和下机序列分析比对等步骤,成功完成对新型冠状病毒和沙门氏菌的全基因组的测定及分析比对,获得全基因组序列覆盖度分别高达99.97%和99.67%。
通过此次培训,微生物检验科工作人员掌握了三代测序的基础理论,具备了独立操作的能力。为日后运用三代测序技术开展突发传染病疫情检测提供了强有力的保障,也标志着市疾控中心微生物检测技术继二代测序后迈上新台阶,实现分子生物学应用、研究里程碑式的跨越,也表明我市疾病预防控制中心在传染病病原体溯源能力方面又有新的突破。
撰稿:高雪
审核:杜阳光